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En una entrevista, Eddie Vedder mencionaría que "Daughter" hablaba sobre una niña con problemas de aprendizaje, y de la forma en que sufre maltrato por parte de sus padres y cómo esto genera rebeldía en ella. La letra de la canción tiene una parte donde menciona: "The shades going down", haciendo referencia al acto de cerrar las cortinas de la casa para que los vecinos no vean lo que sucede en el interior.?